EM菌とは、「EM菌」という菌は存在せず、EM中（有用微生物群）の微生物の集合体の総称として広く使われています。EM（通称:*EM菌）は乳酸菌や酵母など人にも環境にもやさしい微生物たちの共生体です。

EM-1は、乳酸菌、酵母菌が主体になっていて有機物の発行分解を促し、植物の育ちやすい理想の土作りが出来ます。乳酸菌は、病原菌などの悪い菌を、こらしめ、良い菌が増えるように応援してくれる働き者、農薬に頼らず微生物を利用しての食に安全な水稲栽培が出来ます。
EM-3は、光合成菌が主体になっていて農業を営む上で生産性、品質が格段に良くなります。光合成菌の働きを優位にするためには、EM1の施用が大変重要になります、乳酸菌や酵母菌の働きによって土壌環境を良くし光合成菌が働きやすくするということです。

乳酸菌、酵母菌の培養は、糖分と温度があれば簡単に培養出来ますが、光合成菌の培養については簡単には出来ません。農業雑誌などにいろいろな培養の仕方が書かれてありますが、それぞれです。当農園でも顕微鏡で確認しながら大量に培養し水田等に利用しています。